Docking protein argonaute dengan siRNA termodifikasi. [CD-ROM]

Djajanto, Ribka (2013) Docking protein argonaute dengan siRNA termodifikasi. [CD-ROM]. Undergraduate thesis, Widya Mandala Catholic University Surabaya.

[img]
Preview
Text (ABSTRAK)
Abstrak.pdf

Download (368kB) | Preview
[img]
Preview
Text (BAB 1)
Bab 1.pdf

Download (43kB) | Preview
[img] Text (BAB 2)
Bab 2.pdf
Restricted to Registered users only

Download (341kB)
[img] Text (BAB 3)
Bab 3.pdf
Restricted to Registered users only

Download (26kB)
[img] Text (BAB 4)
Bab 4.pdf
Restricted to Registered users only

Download (356kB)
[img]
Preview
Text (BAB 5)
Bab 5.pdf

Download (28kB) | Preview

Abstract

Terapi gen adalah teknik pengobatan terhadap suatu penyakit melalui transfer bahan genetik ke tubuh pasien yaitu dengan mencegah diekspresikannya gen-gen yang abnormal atau dikenal dengan istilah gene silencing. Terapi gen mereparasi mRNA (messenger RNA) pada tahap translasi mRNA yang dikenal dengan istilah small interfering RNA (siRNA) atau RNA interference (RNAi). Penelitian sebelumnya telah mempelajari dupleks siRNA dan siRNA termodifikasi dengan simulasi dinamika molekul. Dalam penelitian ini dilakukan docking protein Argonaute (Ago) dengan siRNA dan empat siRNA termodifikasi yaitu satu modifikasi gugus ribosa, satu modifikasi pada closing base pair, dan dua modifikasi untaian basa dengan menggunakan program AutoDock dan FlexX. Pengamatan dilakukan pada posisi, afinitas ikatan, dan sifat struktural tersebut, yaitu parameter RMSD, ikatan hidrogen, dan jari-jari girasinya. Hasil interaksi docking modifikasi siRNA pasangan basa untaian C-G dengan protein argonaute memiliki afinitas yang lebih besar berdasarkan hasil docking baik dengan menggunakan AutoDock maupun FlexX.

Item Type: Thesis (Undergraduate)
Department: ["eprint_fieldopt_department_Faculty of Pharmacy" not defined]
Uncontrolled Keywords: Terapi gen, RNAi, siRNA, protein Argonaute, Locked Nucleid Acid, pasangan basa canonical, untaian C-G, untaian G-C
Divisions: Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program
Depositing User: Operator 2 Student Staff
Date Deposited: 18 Sep 2014 01:33
Last Modified: 25 Nov 2014 06:03
URI: http://repository.wima.ac.id/id/eprint/90

Actions (login required)

View Item View Item